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空間蛋白組技術(shù)服務(wù)
更新時(shí)間:2026-05-22
訪(fǎng)問(wèn)量:46
廠(chǎng)商性質(zhì):其他
空間蛋白組技術(shù)服務(wù)
一、核心價(jià)值:為什么需要空間蛋白組?
傳統(tǒng) Bulk 蛋白組:組織勻漿后測(cè)整體,無(wú)空間信息,掩蓋區(qū)域異質(zhì)性(如腫瘤邊緣 vs 中心)。
單細(xì)胞蛋白組:拿到單細(xì)胞數(shù)據(jù),但解離破壞原位結(jié)構(gòu),丟失細(xì)胞間空間關(guān)系與微環(huán)境信號(hào)。
空間蛋白組:在完整組織切片上,同時(shí)獲得:蛋白身份 + 表達(dá)量 + 空間坐標(biāo) + 細(xì)胞定位,直接解析原位微環(huán)境與細(xì)胞互作。
二、主流技術(shù)(分兩大陣營(yíng))
1)抗體 - 成像型(原位、高分辨率、中通量)
CODEX/PhenoCycler:寡核苷酸標(biāo)記抗體→多輪染色 - 成像 - 漂白→單張切片測(cè)40–100 種蛋白,亞細(xì)胞分辨率,適合免疫微環(huán)境、腫瘤異質(zhì)性。
IMC(成像質(zhì)譜流式):金屬標(biāo)簽抗體→激光消融→質(zhì)譜檢測(cè),~40 種蛋白,單細(xì)胞分辨率,適合 FFPE 組織、免疫細(xì)胞亞群。
MC成像質(zhì)譜
DSP(NanoString):光切割標(biāo)簽 + 數(shù)字計(jì)數(shù),100–1200 種蛋白 / RNA,可圈選任意 ROI(如腫瘤巢、基質(zhì)),適合臨床樣本、生物標(biāo)志物篩選。
2)質(zhì)譜 - 區(qū)域型(無(wú)偏、高通量、低分辨率)
LCM+LC-MS/MS:激光捕獲顯微切割(LCM)切取目標(biāo)區(qū)域(5–10 μm)→蛋白提取→質(zhì)譜鑒定,數(shù)千種蛋白,無(wú)偏篩選,適合 FFPE / 冷凍組織、差異蛋白發(fā)現(xiàn)。
MALDI-IMS(質(zhì)譜成像):組織切片直接質(zhì)譜掃描,100–1000 種蛋白 / 肽段,空間分辨率 50–200 μm,無(wú)需抗體,適合整體組織分布、腫瘤邊界標(biāo)志物。
三、實(shí)驗(yàn)流程(以 LCM+MS 為例)
1.樣本制備:FFPE / 冷凍組織→5–10 μm 切片→HE / 免疫熒光染色→定位目標(biāo)區(qū)域(ROI)。
2.激光捕獲(LCM):顯微鏡下精準(zhǔn)切割 ROI(如腫瘤、免疫灶)→收集到微量管。
3.蛋白提取與酶解:裂解→yi酶消化→肽段混合物。
4.LC-MS/MS:液相分離→質(zhì)譜檢測(cè)→蛋白鑒定與定量。
5.空間映射:將蛋白表達(dá)量回貼到原始組織圖像,生成空間蛋白圖譜。
四、應(yīng)用場(chǎng)景
腫瘤微環(huán)境:解析腫瘤中心 / 邊緣 / 基質(zhì)的蛋白差異,發(fā)現(xiàn)耐藥亞群、免疫逃逸機(jī)制、新治療靶點(diǎn)。
神經(jīng)科學(xué):阿爾茨海默病斑塊、帕金森病路易小體的原位蛋白網(wǎng)絡(luò),揭示神經(jīng)炎癥與退行機(jī)制。
發(fā)育生物學(xué):胚胎 / 器官發(fā)育的空間蛋白圖譜,追蹤分化軌跡與關(guān)鍵調(diào)控蛋白。
臨床轉(zhuǎn)化:FFPE 樣本中篩選預(yù)后 / 療效標(biāo)志物,指導(dǎo)精準(zhǔn)分型與免疫治療。
空間多組學(xué)整合:空間蛋白組 + 空間轉(zhuǎn)錄組 + 單細(xì)胞,多維解析基因 - 蛋白 - 功能的空間調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
五、與單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別(一句話(huà))
單細(xì)胞測(cè)序:測(cè)單個(gè)細(xì)胞的基因 / 蛋白,無(wú)原位結(jié)構(gòu);
空間蛋白組:測(cè)組織原位的蛋白分布,保留空間架構(gòu),更貼近真實(shí)微環(huán)境。
空間蛋白組技術(shù)服務(wù)





